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20世纪60年代，为实现工农业国的目标，蒙古国立大学分别于1959年和1960年开始培养工业经济师，建筑工程师和地质工程师，为国内发展储备工程师和技术人员。
随着工程和技术教师队伍的不断扩大，理工学院于1969年成为蒙古国立大学的附属单位，下设土木工程、电力工程、地质和采矿、机械工程、工程经济五个学院，共计成立13个系。随后，联合国教科文组织于1970年实施MON-1项目，在一定程度上解决了培训新一代教职工和制造培训设施的问题。1982年，根据蒙古人民共和国（时名）部长会议的决定，理工学院从蒙古国立大学中分离出来，改组为一所独立的大学，即技术大学。
该大学率先进行高等教育改革，在学术课程中实施学分制，教学过程也不断民主化。同时为了适应市场条件，学校积极调整结构，实行学院、教授团队和研究中心的结构模式。在此期间，该学校对外关系急剧扩大，成为国际大学网络的重要组成部分。至此，技术大学已扩大为蒙古科技大学。
自2013年起，我们不断推进该校发展，立志将其转变为一所研究型大学。为此，我们制定了一个目标，让学校结构与世界标准接轨，大幅提升办学质量，增加世界级教授和教职工数量，扩大研究范围，提高效率，不断创新，奋力迈向亚洲200强大学。
