苏伊士运河大学于1976年根据第93号总统决议成立，这是苏伊士运河和西奈地区居民遭受长期的痛苦和牺牲后，为重建该地区而迈出的一步。大学起始阶段有三个院系，即塞得港的工程和技术学院、商业和行政学院以及苏伊士的石油和矿业学院。1977年，伊斯梅利亚分校开设有三个院系：理学院、教育学院和农学院。此后每年都有新的院系成立，到2006年，大学共有23个院系。
共和国分部决议
塞得港分校2010年2月24日第56号决议，将塞得港分校提升为独立大学，命名为塞得港大学。
2012年8月22日苏伊士分校第193号决议，将苏伊士分校提升为独立的大学，命名为苏伊士大学。
2016年4月5日阿里什第147号决议，将阿里什分校升格为独立大学，命名为阿里什大学。
随着三个分校的分离，母体大学仍称为苏伊士运河大学，包含13个院系和两个研究所 。
